Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms