Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES56

Trappc4, Trafficking protein particle complex subunit 4, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc4Q9ES56 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms