Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERP3

Trim54, Tripartite motif-containing protein 54, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim54Q9ERP3 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim54Q9ERP3 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim54Q9ERP3 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim54Q9ERP3 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim54Q9ERP3 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim54Q9ERP3 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim54Q9ERP3 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim54Q9ERP3 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim54Q9ERP3 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim54Q9ERP3 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim54Q9ERP3 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim54Q9ERP3 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim54Q9ERP3 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim54Q9ERP3 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim54Q9ERP3 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim54Q9ERP3 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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