Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms