Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms