Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tlr1Q9EPQ1 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tlr1Q9EPQ1 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tlr1Q9EPQ1 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tlr1Q9EPQ1 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tlr1Q9EPQ1 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tlr1Q9EPQ1 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tlr1Q9EPQ1 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tlr1Q9EPQ1 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tlr1Q9EPQ1 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tlr1Q9EPQ1 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tlr1Q9EPQ1 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tlr1Q9EPQ1 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tlr1Q9EPQ1 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tlr1Q9EPQ1 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tlr1Q9EPQ1 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tlr1Q9EPQ1 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tlr1Q9EPQ1 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tlr1Q9EPQ1 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tlr1Q9EPQ1 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tlr1Q9EPQ1 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tlr1Q9EPQ1 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tlr1Q9EPQ1 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tlr1Q9EPQ1 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tlr1Q9EPQ1 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tlr1Q9EPQ1 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tlr1Q9EPQ1 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tlr1Q9EPQ1 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tlr1Q9EPQ1 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tlr1Q9EPQ1 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tlr1Q9EPQ1 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tlr1Q9EPQ1 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tlr1Q9EPQ1 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tlr1Q9EPQ1 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tlr1Q9EPQ1 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tlr1Q9EPQ1 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tlr1Q9EPQ1 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tlr1Q9EPQ1 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tlr1Q9EPQ1 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tlr1Q9EPQ1 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tlr1Q9EPQ1 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tlr1Q9EPQ1 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tlr1Q9EPQ1 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tlr1Q9EPQ1 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tlr1Q9EPQ1 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tlr1Q9EPQ1 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tlr1Q9EPQ1 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tlr1Q9EPQ1 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tlr1Q9EPQ1 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tlr1Q9EPQ1 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tlr1Q9EPQ1 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tlr1Q9EPQ1 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tlr1Q9EPQ1 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Tlr1Q9EPQ1 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tlr1Q9EPQ1 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Tlr1Q9EPQ1 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tlr1Q9EPQ1 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tlr1Q9EPQ1 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tlr1Q9EPQ1 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tlr1Q9EPQ1 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tlr1Q9EPQ1 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tlr1Q9EPQ1 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tlr1Q9EPQ1 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tlr1Q9EPQ1 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tlr1Q9EPQ1 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tlr1Q9EPQ1 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tlr1Q9EPQ1 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tlr1Q9EPQ1 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tlr1Q9EPQ1 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tlr1Q9EPQ1 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tlr1Q9EPQ1 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tlr1Q9EPQ1 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tlr1Q9EPQ1 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tlr1Q9EPQ1 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tlr1Q9EPQ1 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tlr1Q9EPQ1 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tlr1Q9EPQ1 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tlr1Q9EPQ1 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tlr1Q9EPQ1 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tlr1Q9EPQ1 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tlr1Q9EPQ1 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tlr1Q9EPQ1 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tlr1Q9EPQ1 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tlr1Q9EPQ1 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tlr1Q9EPQ1 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tlr1Q9EPQ1 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tlr1Q9EPQ1 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tlr1Q9EPQ1 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tlr1Q9EPQ1 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tlr1Q9EPQ1 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tlr1Q9EPQ1 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tlr1Q9EPQ1 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tlr1Q9EPQ1 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tlr1Q9EPQ1 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tlr1Q9EPQ1 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tlr1Q9EPQ1 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tlr1Q9EPQ1 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tlr1Q9EPQ1 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tlr1Q9EPQ1 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tlr1Q9EPQ1 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms