Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Swt1Q9DBQ9 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms