Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBC3

Cmtr1, Cap-specific mRNA (nucleoside-2'-O-)-methyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtr1Q9DBC3 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cmtr1Q9DBC3 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms