Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms