Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D5

Tmco5a, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5aQ9D9D5 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Tmco5aQ9D9D5 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmco5aQ9D9D5 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Tmco5aQ9D9D5 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmco5aQ9D9D5 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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