Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms