Protein–RNA interactions for Protein: Q9D816

Cyp2c55, Cytochrome P450 2C55, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c55Q9D816 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cyp2c55Q9D816 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cyp2c55Q9D816 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms