Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Capn9Q9D805 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capn9Q9D805 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capn9Q9D805 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capn9Q9D805 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capn9Q9D805 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capn9Q9D805 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capn9Q9D805 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capn9Q9D805 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms