Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F4

Gabra4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra4Q9D6F4 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gabra4Q9D6F4 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gabra4Q9D6F4 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gabra4Q9D6F4 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gabra4Q9D6F4 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gabra4Q9D6F4 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gabra4Q9D6F4 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gabra4Q9D6F4 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gabra4Q9D6F4 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gabra4Q9D6F4 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gabra4Q9D6F4 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gabra4Q9D6F4 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gabra4Q9D6F4 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gabra4Q9D6F4 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gabra4Q9D6F4 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gabra4Q9D6F4 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gabra4Q9D6F4 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gabra4Q9D6F4 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gabra4Q9D6F4 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gabra4Q9D6F4 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gabra4Q9D6F4 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gabra4Q9D6F4 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gabra4Q9D6F4 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gabra4Q9D6F4 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabra4Q9D6F4 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabra4Q9D6F4 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabra4Q9D6F4 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabra4Q9D6F4 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabra4Q9D6F4 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabra4Q9D6F4 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabra4Q9D6F4 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabra4Q9D6F4 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabra4Q9D6F4 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabra4Q9D6F4 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabra4Q9D6F4 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabra4Q9D6F4 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabra4Q9D6F4 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabra4Q9D6F4 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabra4Q9D6F4 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabra4Q9D6F4 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabra4Q9D6F4 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabra4Q9D6F4 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabra4Q9D6F4 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabra4Q9D6F4 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabra4Q9D6F4 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabra4Q9D6F4 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabra4Q9D6F4 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabra4Q9D6F4 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabra4Q9D6F4 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabra4Q9D6F4 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabra4Q9D6F4 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabra4Q9D6F4 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabra4Q9D6F4 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabra4Q9D6F4 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabra4Q9D6F4 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabra4Q9D6F4 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabra4Q9D6F4 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabra4Q9D6F4 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabra4Q9D6F4 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabra4Q9D6F4 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabra4Q9D6F4 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabra4Q9D6F4 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabra4Q9D6F4 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabra4Q9D6F4 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabra4Q9D6F4 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabra4Q9D6F4 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabra4Q9D6F4 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabra4Q9D6F4 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabra4Q9D6F4 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabra4Q9D6F4 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabra4Q9D6F4 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabra4Q9D6F4 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabra4Q9D6F4 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabra4Q9D6F4 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabra4Q9D6F4 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabra4Q9D6F4 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabra4Q9D6F4 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabra4Q9D6F4 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabra4Q9D6F4 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabra4Q9D6F4 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabra4Q9D6F4 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabra4Q9D6F4 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabra4Q9D6F4 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabra4Q9D6F4 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabra4Q9D6F4 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabra4Q9D6F4 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabra4Q9D6F4 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabra4Q9D6F4 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabra4Q9D6F4 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabra4Q9D6F4 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabra4Q9D6F4 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabra4Q9D6F4 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabra4Q9D6F4 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabra4Q9D6F4 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabra4Q9D6F4 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabra4Q9D6F4 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabra4Q9D6F4 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabra4Q9D6F4 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabra4Q9D6F4 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabra4Q9D6F4 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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