Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms