Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4E6

Pabpc6, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc6Q9D4E6 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pabpc6Q9D4E6 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms