Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rufy3Q9D394 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rufy3Q9D394 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rufy3Q9D394 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rufy3Q9D394 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rufy3Q9D394 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rufy3Q9D394 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rufy3Q9D394 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rufy3Q9D394 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rufy3Q9D394 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rufy3Q9D394 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rufy3Q9D394 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rufy3Q9D394 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Rufy3Q9D394 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Rufy3Q9D394 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Rufy3Q9D394 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Rufy3Q9D394 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rufy3Q9D394 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rufy3Q9D394 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rufy3Q9D394 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rufy3Q9D394 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rufy3Q9D394 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rufy3Q9D394 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rufy3Q9D394 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rufy3Q9D394 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rufy3Q9D394 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rufy3Q9D394 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rufy3Q9D394 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rufy3Q9D394 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rufy3Q9D394 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rufy3Q9D394 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rufy3Q9D394 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms