Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Krt20Q9D312 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Krt20Q9D312 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Krt20Q9D312 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Krt20Q9D312 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Krt20Q9D312 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Krt20Q9D312 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Krt20Q9D312 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Krt20Q9D312 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Krt20Q9D312 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Krt20Q9D312 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Krt20Q9D312 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Krt20Q9D312 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Krt20Q9D312 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Krt20Q9D312 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Krt20Q9D312 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Krt20Q9D312 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Krt20Q9D312 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Krt20Q9D312 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Krt20Q9D312 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Krt20Q9D312 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Krt20Q9D312 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Krt20Q9D312 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Krt20Q9D312 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Krt20Q9D312 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Krt20Q9D312 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Krt20Q9D312 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Krt20Q9D312 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Krt20Q9D312 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms