Protein–RNA interactions for Protein: Q9D103

Ifitm1, Interferon-induced transmembrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm1Q9D103 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifitm1Q9D103 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifitm1Q9D103 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifitm1Q9D103 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifitm1Q9D103 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifitm1Q9D103 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifitm1Q9D103 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifitm1Q9D103 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifitm1Q9D103 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifitm1Q9D103 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifitm1Q9D103 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifitm1Q9D103 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifitm1Q9D103 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifitm1Q9D103 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifitm1Q9D103 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifitm1Q9D103 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifitm1Q9D103 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifitm1Q9D103 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifitm1Q9D103 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifitm1Q9D103 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifitm1Q9D103 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifitm1Q9D103 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifitm1Q9D103 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifitm1Q9D103 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifitm1Q9D103 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifitm1Q9D103 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifitm1Q9D103 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifitm1Q9D103 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifitm1Q9D103 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifitm1Q9D103 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifitm1Q9D103 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifitm1Q9D103 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifitm1Q9D103 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifitm1Q9D103 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifitm1Q9D103 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifitm1Q9D103 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifitm1Q9D103 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifitm1Q9D103 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifitm1Q9D103 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifitm1Q9D103 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifitm1Q9D103 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifitm1Q9D103 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifitm1Q9D103 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifitm1Q9D103 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifitm1Q9D103 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifitm1Q9D103 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifitm1Q9D103 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifitm1Q9D103 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifitm1Q9D103 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifitm1Q9D103 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifitm1Q9D103 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifitm1Q9D103 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifitm1Q9D103 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifitm1Q9D103 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifitm1Q9D103 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifitm1Q9D103 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifitm1Q9D103 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifitm1Q9D103 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifitm1Q9D103 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifitm1Q9D103 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifitm1Q9D103 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifitm1Q9D103 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifitm1Q9D103 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifitm1Q9D103 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifitm1Q9D103 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifitm1Q9D103 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifitm1Q9D103 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifitm1Q9D103 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifitm1Q9D103 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifitm1Q9D103 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifitm1Q9D103 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifitm1Q9D103 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifitm1Q9D103 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifitm1Q9D103 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifitm1Q9D103 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifitm1Q9D103 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifitm1Q9D103 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifitm1Q9D103 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifitm1Q9D103 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifitm1Q9D103 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ifitm1Q9D103 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ifitm1Q9D103 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ifitm1Q9D103 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ifitm1Q9D103 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ifitm1Q9D103 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ifitm1Q9D103 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ifitm1Q9D103 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ifitm1Q9D103 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ifitm1Q9D103 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ifitm1Q9D103 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ifitm1Q9D103 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ifitm1Q9D103 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ifitm1Q9D103 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ifitm1Q9D103 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ifitm1Q9D103 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ifitm1Q9D103 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ifitm1Q9D103 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ifitm1Q9D103 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ifitm1Q9D103 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ifitm1Q9D103 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms