Protein–RNA interactions for Protein: Q9D071

Mms19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mms19Q9D071 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms