Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

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Length 258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
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Snf8Q9CZ28 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Snf8Q9CZ28 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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