Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms