Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP3

Chchd5, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd5Q9CQP3 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Chchd5Q9CQP3 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Chchd5Q9CQP3 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Chchd5Q9CQP3 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Chchd5Q9CQP3 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Chchd5Q9CQP3 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Chchd5Q9CQP3 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Chchd5Q9CQP3 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Chchd5Q9CQP3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Chchd5Q9CQP3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Chchd5Q9CQP3 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Chchd5Q9CQP3 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Chchd5Q9CQP3 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Chchd5Q9CQP3 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Chchd5Q9CQP3 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Chchd5Q9CQP3 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Chchd5Q9CQP3 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Chchd5Q9CQP3 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Chchd5Q9CQP3 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Chchd5Q9CQP3 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Chchd5Q9CQP3 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Chchd5Q9CQP3 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Chchd5Q9CQP3 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Chchd5Q9CQP3 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Chchd5Q9CQP3 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Chchd5Q9CQP3 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Chchd5Q9CQP3 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Chchd5Q9CQP3 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Chchd5Q9CQP3 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Chchd5Q9CQP3 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Chchd5Q9CQP3 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Chchd5Q9CQP3 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Chchd5Q9CQP3 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Chchd5Q9CQP3 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Chchd5Q9CQP3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Chchd5Q9CQP3 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Chchd5Q9CQP3 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Chchd5Q9CQP3 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Chchd5Q9CQP3 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Chchd5Q9CQP3 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Chchd5Q9CQP3 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Chchd5Q9CQP3 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Chchd5Q9CQP3 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Chchd5Q9CQP3 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Chchd5Q9CQP3 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Chchd5Q9CQP3 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Chchd5Q9CQP3 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Chchd5Q9CQP3 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Chchd5Q9CQP3 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Chchd5Q9CQP3 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Chchd5Q9CQP3 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Chchd5Q9CQP3 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Chchd5Q9CQP3 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Chchd5Q9CQP3 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Chchd5Q9CQP3 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Chchd5Q9CQP3 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Chchd5Q9CQP3 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Chchd5Q9CQP3 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Chchd5Q9CQP3 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Chchd5Q9CQP3 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Chchd5Q9CQP3 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Chchd5Q9CQP3 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Chchd5Q9CQP3 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Chchd5Q9CQP3 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Chchd5Q9CQP3 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Chchd5Q9CQP3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Chchd5Q9CQP3 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Chchd5Q9CQP3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Chchd5Q9CQP3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Chchd5Q9CQP3 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Chchd5Q9CQP3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Chchd5Q9CQP3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Chchd5Q9CQP3 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Chchd5Q9CQP3 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Chchd5Q9CQP3 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Chchd5Q9CQP3 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Chchd5Q9CQP3 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Chchd5Q9CQP3 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Chchd5Q9CQP3 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Chchd5Q9CQP3 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Chchd5Q9CQP3 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Chchd5Q9CQP3 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Chchd5Q9CQP3 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Chchd5Q9CQP3 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Chchd5Q9CQP3 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Chchd5Q9CQP3 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Chchd5Q9CQP3 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Chchd5Q9CQP3 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Chchd5Q9CQP3 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Chchd5Q9CQP3 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Chchd5Q9CQP3 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Chchd5Q9CQP3 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Chchd5Q9CQP3 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Chchd5Q9CQP3 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Chchd5Q9CQP3 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Chchd5Q9CQP3 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Chchd5Q9CQP3 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Chchd5Q9CQP3 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Chchd5Q9CQP3 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Chchd5Q9CQP3 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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