Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM1

Type III endosome membrane protein TEMP, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQM1 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9CQM1 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9CQM1 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9CQM1 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9CQM1 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9CQM1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9CQM1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9CQM1 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9CQM1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9CQM1 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9CQM1 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9CQM1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9CQM1 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9CQM1 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9CQM1 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9CQM1 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9CQM1 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9CQM1 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9CQM1 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9CQM1 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9CQM1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9CQM1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9CQM1 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9CQM1 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9CQM1 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9CQM1 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9CQM1 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9CQM1 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9CQM1 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9CQM1 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9CQM1 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9CQM1 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9CQM1 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9CQM1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9CQM1 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9CQM1 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9CQM1 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9CQM1 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9CQM1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9CQM1 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9CQM1 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9CQM1 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9CQM1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9CQM1 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9CQM1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9CQM1 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9CQM1 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9CQM1 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9CQM1 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9CQM1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9CQM1 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9CQM1 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9CQM1 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9CQM1 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9CQM1 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9CQM1 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9CQM1 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9CQM1 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9CQM1 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9CQM1 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9CQM1 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9CQM1 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9CQM1 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9CQM1 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9CQM1 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9CQM1 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9CQM1 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9CQM1 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9CQM1 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9CQM1 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9CQM1 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9CQM1 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9CQM1 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9CQM1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9CQM1 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9CQM1 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9CQM1 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9CQM1 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9CQM1 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9CQM1 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9CQM1 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9CQM1 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9CQM1 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9CQM1 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9CQM1 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9CQM1 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9CQM1 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9CQM1 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9CQM1 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9CQM1 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9CQM1 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9CQM1 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9CQM1 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9CQM1 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9CQM1 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9CQM1 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9CQM1 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9CQM1 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9CQM1 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9CQM1 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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