Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL6

Mrpl35, 39S ribosomal protein L35, mitochondrial, mousemouse

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl35Q9CQL6 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms