Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ6

Denr, Density-regulated protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DenrQ9CQJ6 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DenrQ9CQJ6 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DenrQ9CQJ6 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DenrQ9CQJ6 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DenrQ9CQJ6 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DenrQ9CQJ6 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DenrQ9CQJ6 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DenrQ9CQJ6 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DenrQ9CQJ6 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DenrQ9CQJ6 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DenrQ9CQJ6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DenrQ9CQJ6 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DenrQ9CQJ6 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DenrQ9CQJ6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DenrQ9CQJ6 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DenrQ9CQJ6 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DenrQ9CQJ6 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DenrQ9CQJ6 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DenrQ9CQJ6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DenrQ9CQJ6 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DenrQ9CQJ6 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
DenrQ9CQJ6 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DenrQ9CQJ6 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DenrQ9CQJ6 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DenrQ9CQJ6 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DenrQ9CQJ6 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DenrQ9CQJ6 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DenrQ9CQJ6 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DenrQ9CQJ6 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DenrQ9CQJ6 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DenrQ9CQJ6 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DenrQ9CQJ6 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DenrQ9CQJ6 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DenrQ9CQJ6 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DenrQ9CQJ6 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DenrQ9CQJ6 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DenrQ9CQJ6 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DenrQ9CQJ6 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DenrQ9CQJ6 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DenrQ9CQJ6 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DenrQ9CQJ6 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DenrQ9CQJ6 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DenrQ9CQJ6 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DenrQ9CQJ6 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DenrQ9CQJ6 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DenrQ9CQJ6 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DenrQ9CQJ6 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DenrQ9CQJ6 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DenrQ9CQJ6 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DenrQ9CQJ6 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DenrQ9CQJ6 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DenrQ9CQJ6 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DenrQ9CQJ6 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DenrQ9CQJ6 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DenrQ9CQJ6 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DenrQ9CQJ6 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DenrQ9CQJ6 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DenrQ9CQJ6 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
DenrQ9CQJ6 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DenrQ9CQJ6 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DenrQ9CQJ6 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DenrQ9CQJ6 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DenrQ9CQJ6 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DenrQ9CQJ6 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DenrQ9CQJ6 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DenrQ9CQJ6 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DenrQ9CQJ6 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DenrQ9CQJ6 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DenrQ9CQJ6 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DenrQ9CQJ6 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DenrQ9CQJ6 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DenrQ9CQJ6 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DenrQ9CQJ6 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DenrQ9CQJ6 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DenrQ9CQJ6 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DenrQ9CQJ6 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
DenrQ9CQJ6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DenrQ9CQJ6 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DenrQ9CQJ6 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DenrQ9CQJ6 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DenrQ9CQJ6 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DenrQ9CQJ6 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DenrQ9CQJ6 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DenrQ9CQJ6 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DenrQ9CQJ6 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DenrQ9CQJ6 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DenrQ9CQJ6 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DenrQ9CQJ6 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DenrQ9CQJ6 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DenrQ9CQJ6 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DenrQ9CQJ6 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DenrQ9CQJ6 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DenrQ9CQJ6 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DenrQ9CQJ6 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DenrQ9CQJ6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DenrQ9CQJ6 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DenrQ9CQJ6 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DenrQ9CQJ6 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DenrQ9CQJ6 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DenrQ9CQJ6 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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