Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Brms1Q99N20 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms