Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME7

Tbx19, T-box transcription factor TBX19, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbx19Q99ME7 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tbx19Q99ME7 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tbx19Q99ME7 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tbx19Q99ME7 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tbx19Q99ME7 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tbx19Q99ME7 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tbx19Q99ME7 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tbx19Q99ME7 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tbx19Q99ME7 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tbx19Q99ME7 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tbx19Q99ME7 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tbx19Q99ME7 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tbx19Q99ME7 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tbx19Q99ME7 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tbx19Q99ME7 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tbx19Q99ME7 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tbx19Q99ME7 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tbx19Q99ME7 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Tbx19Q99ME7 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Tbx19Q99ME7 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tbx19Q99ME7 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tbx19Q99ME7 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tbx19Q99ME7 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tbx19Q99ME7 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tbx19Q99ME7 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tbx19Q99ME7 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tbx19Q99ME7 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tbx19Q99ME7 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tbx19Q99ME7 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tbx19Q99ME7 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Tbx19Q99ME7 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tbx19Q99ME7 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tbx19Q99ME7 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tbx19Q99ME7 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tbx19Q99ME7 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tbx19Q99ME7 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tbx19Q99ME7 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tbx19Q99ME7 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tbx19Q99ME7 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tbx19Q99ME7 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tbx19Q99ME7 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tbx19Q99ME7 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tbx19Q99ME7 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Tbx19Q99ME7 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tbx19Q99ME7 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tbx19Q99ME7 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tbx19Q99ME7 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tbx19Q99ME7 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tbx19Q99ME7 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tbx19Q99ME7 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tbx19Q99ME7 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tbx19Q99ME7 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tbx19Q99ME7 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tbx19Q99ME7 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tbx19Q99ME7 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tbx19Q99ME7 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tbx19Q99ME7 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tbx19Q99ME7 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tbx19Q99ME7 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tbx19Q99ME7 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tbx19Q99ME7 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tbx19Q99ME7 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Tbx19Q99ME7 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tbx19Q99ME7 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Tbx19Q99ME7 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Tbx19Q99ME7 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tbx19Q99ME7 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tbx19Q99ME7 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tbx19Q99ME7 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tbx19Q99ME7 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tbx19Q99ME7 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tbx19Q99ME7 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tbx19Q99ME7 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tbx19Q99ME7 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tbx19Q99ME7 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tbx19Q99ME7 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tbx19Q99ME7 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tbx19Q99ME7 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tbx19Q99ME7 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tbx19Q99ME7 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tbx19Q99ME7 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tbx19Q99ME7 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tbx19Q99ME7 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tbx19Q99ME7 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tbx19Q99ME7 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tbx19Q99ME7 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Tbx19Q99ME7 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tbx19Q99ME7 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tbx19Q99ME7 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tbx19Q99ME7 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tbx19Q99ME7 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tbx19Q99ME7 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tbx19Q99ME7 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tbx19Q99ME7 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Tbx19Q99ME7 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Tbx19Q99ME7 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tbx19Q99ME7 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tbx19Q99ME7 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tbx19Q99ME7 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tbx19Q99ME7 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms