Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB3

Tm2d1, TM2 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm2d1Q99MB3 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tm2d1Q99MB3 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tm2d1Q99MB3 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tm2d1Q99MB3 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tm2d1Q99MB3 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tm2d1Q99MB3 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tm2d1Q99MB3 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tm2d1Q99MB3 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tm2d1Q99MB3 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tm2d1Q99MB3 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tm2d1Q99MB3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tm2d1Q99MB3 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tm2d1Q99MB3 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tm2d1Q99MB3 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tm2d1Q99MB3 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tm2d1Q99MB3 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tm2d1Q99MB3 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Tm2d1Q99MB3 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tm2d1Q99MB3 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tm2d1Q99MB3 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tm2d1Q99MB3 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tm2d1Q99MB3 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tm2d1Q99MB3 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tm2d1Q99MB3 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tm2d1Q99MB3 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tm2d1Q99MB3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tm2d1Q99MB3 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tm2d1Q99MB3 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tm2d1Q99MB3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tm2d1Q99MB3 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tm2d1Q99MB3 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tm2d1Q99MB3 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Tm2d1Q99MB3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tm2d1Q99MB3 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Tm2d1Q99MB3 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tm2d1Q99MB3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tm2d1Q99MB3 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tm2d1Q99MB3 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tm2d1Q99MB3 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tm2d1Q99MB3 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tm2d1Q99MB3 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tm2d1Q99MB3 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tm2d1Q99MB3 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tm2d1Q99MB3 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tm2d1Q99MB3 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tm2d1Q99MB3 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Tm2d1Q99MB3 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tm2d1Q99MB3 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tm2d1Q99MB3 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tm2d1Q99MB3 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tm2d1Q99MB3 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tm2d1Q99MB3 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tm2d1Q99MB3 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tm2d1Q99MB3 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tm2d1Q99MB3 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tm2d1Q99MB3 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tm2d1Q99MB3 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tm2d1Q99MB3 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tm2d1Q99MB3 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tm2d1Q99MB3 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tm2d1Q99MB3 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tm2d1Q99MB3 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tm2d1Q99MB3 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tm2d1Q99MB3 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tm2d1Q99MB3 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tm2d1Q99MB3 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tm2d1Q99MB3 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tm2d1Q99MB3 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tm2d1Q99MB3 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tm2d1Q99MB3 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tm2d1Q99MB3 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tm2d1Q99MB3 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tm2d1Q99MB3 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tm2d1Q99MB3 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Tm2d1Q99MB3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tm2d1Q99MB3 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tm2d1Q99MB3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tm2d1Q99MB3 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tm2d1Q99MB3 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tm2d1Q99MB3 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tm2d1Q99MB3 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tm2d1Q99MB3 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tm2d1Q99MB3 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tm2d1Q99MB3 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tm2d1Q99MB3 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Tm2d1Q99MB3 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tm2d1Q99MB3 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tm2d1Q99MB3 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tm2d1Q99MB3 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tm2d1Q99MB3 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tm2d1Q99MB3 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tm2d1Q99MB3 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tm2d1Q99MB3 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tm2d1Q99MB3 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tm2d1Q99MB3 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tm2d1Q99MB3 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tm2d1Q99MB3 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tm2d1Q99MB3 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tm2d1Q99MB3 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tm2d1Q99MB3 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms