Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB1

Tlr3, Toll-like receptor 3, mousemouse

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Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr3Q99MB1 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tlr3Q99MB1 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tlr3Q99MB1 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tlr3Q99MB1 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tlr3Q99MB1 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tlr3Q99MB1 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tlr3Q99MB1 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tlr3Q99MB1 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tlr3Q99MB1 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tlr3Q99MB1 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tlr3Q99MB1 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tlr3Q99MB1 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tlr3Q99MB1 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tlr3Q99MB1 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tlr3Q99MB1 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tlr3Q99MB1 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tlr3Q99MB1 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tlr3Q99MB1 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tlr3Q99MB1 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tlr3Q99MB1 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tlr3Q99MB1 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tlr3Q99MB1 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tlr3Q99MB1 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tlr3Q99MB1 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tlr3Q99MB1 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tlr3Q99MB1 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tlr3Q99MB1 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tlr3Q99MB1 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tlr3Q99MB1 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tlr3Q99MB1 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tlr3Q99MB1 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tlr3Q99MB1 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tlr3Q99MB1 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tlr3Q99MB1 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tlr3Q99MB1 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tlr3Q99MB1 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tlr3Q99MB1 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tlr3Q99MB1 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tlr3Q99MB1 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tlr3Q99MB1 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tlr3Q99MB1 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tlr3Q99MB1 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tlr3Q99MB1 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tlr3Q99MB1 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tlr3Q99MB1 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tlr3Q99MB1 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tlr3Q99MB1 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tlr3Q99MB1 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tlr3Q99MB1 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tlr3Q99MB1 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tlr3Q99MB1 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tlr3Q99MB1 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tlr3Q99MB1 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tlr3Q99MB1 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tlr3Q99MB1 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tlr3Q99MB1 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tlr3Q99MB1 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tlr3Q99MB1 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tlr3Q99MB1 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tlr3Q99MB1 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tlr3Q99MB1 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tlr3Q99MB1 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tlr3Q99MB1 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Tlr3Q99MB1 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tlr3Q99MB1 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tlr3Q99MB1 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tlr3Q99MB1 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Tlr3Q99MB1 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tlr3Q99MB1 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tlr3Q99MB1 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tlr3Q99MB1 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tlr3Q99MB1 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tlr3Q99MB1 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tlr3Q99MB1 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tlr3Q99MB1 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tlr3Q99MB1 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tlr3Q99MB1 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tlr3Q99MB1 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tlr3Q99MB1 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tlr3Q99MB1 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tlr3Q99MB1 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tlr3Q99MB1 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tlr3Q99MB1 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tlr3Q99MB1 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tlr3Q99MB1 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tlr3Q99MB1 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tlr3Q99MB1 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tlr3Q99MB1 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tlr3Q99MB1 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tlr3Q99MB1 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tlr3Q99MB1 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tlr3Q99MB1 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tlr3Q99MB1 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tlr3Q99MB1 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tlr3Q99MB1 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tlr3Q99MB1 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tlr3Q99MB1 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tlr3Q99MB1 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms