Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hps4Q99KG7 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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