Protein–RNA interactions for Protein: Q99KF1

Tmed9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed9Q99KF1 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tmed9Q99KF1 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tmed9Q99KF1 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tmed9Q99KF1 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tmed9Q99KF1 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tmed9Q99KF1 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tmed9Q99KF1 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmed9Q99KF1 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmed9Q99KF1 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmed9Q99KF1 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmed9Q99KF1 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmed9Q99KF1 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmed9Q99KF1 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmed9Q99KF1 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmed9Q99KF1 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmed9Q99KF1 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmed9Q99KF1 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmed9Q99KF1 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmed9Q99KF1 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmed9Q99KF1 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmed9Q99KF1 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmed9Q99KF1 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmed9Q99KF1 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmed9Q99KF1 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmed9Q99KF1 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmed9Q99KF1 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmed9Q99KF1 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmed9Q99KF1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmed9Q99KF1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmed9Q99KF1 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmed9Q99KF1 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmed9Q99KF1 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmed9Q99KF1 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmed9Q99KF1 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmed9Q99KF1 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmed9Q99KF1 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmed9Q99KF1 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmed9Q99KF1 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmed9Q99KF1 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmed9Q99KF1 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmed9Q99KF1 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmed9Q99KF1 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmed9Q99KF1 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmed9Q99KF1 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmed9Q99KF1 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmed9Q99KF1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmed9Q99KF1 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmed9Q99KF1 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmed9Q99KF1 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmed9Q99KF1 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmed9Q99KF1 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmed9Q99KF1 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmed9Q99KF1 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmed9Q99KF1 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmed9Q99KF1 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmed9Q99KF1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmed9Q99KF1 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmed9Q99KF1 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmed9Q99KF1 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmed9Q99KF1 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmed9Q99KF1 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmed9Q99KF1 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmed9Q99KF1 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmed9Q99KF1 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmed9Q99KF1 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmed9Q99KF1 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmed9Q99KF1 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmed9Q99KF1 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmed9Q99KF1 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmed9Q99KF1 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmed9Q99KF1 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmed9Q99KF1 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmed9Q99KF1 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmed9Q99KF1 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmed9Q99KF1 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmed9Q99KF1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmed9Q99KF1 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmed9Q99KF1 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmed9Q99KF1 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmed9Q99KF1 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmed9Q99KF1 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmed9Q99KF1 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmed9Q99KF1 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmed9Q99KF1 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmed9Q99KF1 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmed9Q99KF1 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmed9Q99KF1 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmed9Q99KF1 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmed9Q99KF1 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmed9Q99KF1 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmed9Q99KF1 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmed9Q99KF1 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmed9Q99KF1 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmed9Q99KF1 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmed9Q99KF1 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmed9Q99KF1 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmed9Q99KF1 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmed9Q99KF1 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmed9Q99KF1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmed9Q99KF1 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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