Protein–RNA interactions for Protein: Q99J83

Atg5, Autophagy protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg5Q99J83 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Atg5Q99J83 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Atg5Q99J83 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Atg5Q99J83 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Atg5Q99J83 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Atg5Q99J83 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Atg5Q99J83 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Atg5Q99J83 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Atg5Q99J83 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Atg5Q99J83 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Atg5Q99J83 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Atg5Q99J83 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Atg5Q99J83 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Atg5Q99J83 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Atg5Q99J83 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Atg5Q99J83 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Atg5Q99J83 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Atg5Q99J83 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Atg5Q99J83 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Atg5Q99J83 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Atg5Q99J83 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Atg5Q99J83 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Atg5Q99J83 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Atg5Q99J83 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Atg5Q99J83 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Atg5Q99J83 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Atg5Q99J83 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Atg5Q99J83 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Atg5Q99J83 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Atg5Q99J83 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Atg5Q99J83 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Atg5Q99J83 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Atg5Q99J83 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Atg5Q99J83 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Atg5Q99J83 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Atg5Q99J83 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Atg5Q99J83 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Atg5Q99J83 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Atg5Q99J83 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Atg5Q99J83 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Atg5Q99J83 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Atg5Q99J83 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Atg5Q99J83 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Atg5Q99J83 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Atg5Q99J83 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Atg5Q99J83 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Atg5Q99J83 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Atg5Q99J83 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Atg5Q99J83 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Atg5Q99J83 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Atg5Q99J83 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Atg5Q99J83 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Atg5Q99J83 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Atg5Q99J83 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Atg5Q99J83 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Atg5Q99J83 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Atg5Q99J83 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Atg5Q99J83 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Atg5Q99J83 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Atg5Q99J83 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Atg5Q99J83 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Atg5Q99J83 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Atg5Q99J83 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Atg5Q99J83 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Atg5Q99J83 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Atg5Q99J83 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Atg5Q99J83 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Atg5Q99J83 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Atg5Q99J83 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg5Q99J83 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg5Q99J83 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg5Q99J83 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg5Q99J83 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg5Q99J83 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg5Q99J83 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg5Q99J83 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg5Q99J83 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg5Q99J83 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg5Q99J83 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg5Q99J83 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg5Q99J83 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg5Q99J83 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg5Q99J83 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg5Q99J83 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg5Q99J83 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg5Q99J83 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg5Q99J83 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg5Q99J83 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg5Q99J83 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg5Q99J83 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg5Q99J83 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg5Q99J83 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg5Q99J83 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg5Q99J83 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg5Q99J83 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg5Q99J83 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg5Q99J83 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg5Q99J83 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg5Q99J83 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg5Q99J83 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms