Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms