Protein–RNA interactions for Protein: Q925H1

Trps1, Zinc finger transcription factor Trps1, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trps1Q925H1 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trps1Q925H1 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trps1Q925H1 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trps1Q925H1 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trps1Q925H1 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trps1Q925H1 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trps1Q925H1 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trps1Q925H1 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trps1Q925H1 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trps1Q925H1 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trps1Q925H1 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trps1Q925H1 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trps1Q925H1 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trps1Q925H1 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trps1Q925H1 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trps1Q925H1 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trps1Q925H1 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trps1Q925H1 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trps1Q925H1 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trps1Q925H1 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trps1Q925H1 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trps1Q925H1 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trps1Q925H1 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trps1Q925H1 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trps1Q925H1 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trps1Q925H1 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trps1Q925H1 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trps1Q925H1 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trps1Q925H1 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trps1Q925H1 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trps1Q925H1 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trps1Q925H1 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trps1Q925H1 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trps1Q925H1 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trps1Q925H1 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trps1Q925H1 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trps1Q925H1 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trps1Q925H1 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trps1Q925H1 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trps1Q925H1 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trps1Q925H1 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trps1Q925H1 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trps1Q925H1 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trps1Q925H1 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trps1Q925H1 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trps1Q925H1 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trps1Q925H1 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trps1Q925H1 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trps1Q925H1 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trps1Q925H1 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trps1Q925H1 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trps1Q925H1 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trps1Q925H1 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trps1Q925H1 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trps1Q925H1 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trps1Q925H1 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trps1Q925H1 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trps1Q925H1 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trps1Q925H1 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trps1Q925H1 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trps1Q925H1 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trps1Q925H1 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trps1Q925H1 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trps1Q925H1 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trps1Q925H1 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trps1Q925H1 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trps1Q925H1 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trps1Q925H1 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trps1Q925H1 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trps1Q925H1 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trps1Q925H1 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trps1Q925H1 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trps1Q925H1 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trps1Q925H1 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trps1Q925H1 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trps1Q925H1 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trps1Q925H1 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trps1Q925H1 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trps1Q925H1 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trps1Q925H1 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trps1Q925H1 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trps1Q925H1 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trps1Q925H1 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trps1Q925H1 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trps1Q925H1 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trps1Q925H1 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trps1Q925H1 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trps1Q925H1 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trps1Q925H1 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trps1Q925H1 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trps1Q925H1 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trps1Q925H1 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trps1Q925H1 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trps1Q925H1 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trps1Q925H1 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trps1Q925H1 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trps1Q925H1 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trps1Q925H1 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trps1Q925H1 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trps1Q925H1 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms