Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf144aQ925F3 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf144aQ925F3 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf144aQ925F3 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf144aQ925F3 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf144aQ925F3 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf144aQ925F3 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf144aQ925F3 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf144aQ925F3 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf144aQ925F3 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf144aQ925F3 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf144aQ925F3 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf144aQ925F3 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf144aQ925F3 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf144aQ925F3 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf144aQ925F3 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf144aQ925F3 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf144aQ925F3 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf144aQ925F3 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf144aQ925F3 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf144aQ925F3 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf144aQ925F3 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf144aQ925F3 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf144aQ925F3 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf144aQ925F3 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf144aQ925F3 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf144aQ925F3 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf144aQ925F3 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf144aQ925F3 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf144aQ925F3 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf144aQ925F3 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf144aQ925F3 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf144aQ925F3 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf144aQ925F3 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf144aQ925F3 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf144aQ925F3 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf144aQ925F3 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf144aQ925F3 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf144aQ925F3 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf144aQ925F3 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf144aQ925F3 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf144aQ925F3 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf144aQ925F3 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf144aQ925F3 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf144aQ925F3 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf144aQ925F3 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf144aQ925F3 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf144aQ925F3 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf144aQ925F3 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf144aQ925F3 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Rnf144aQ925F3 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf144aQ925F3 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf144aQ925F3 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf144aQ925F3 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf144aQ925F3 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf144aQ925F3 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf144aQ925F3 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Rnf144aQ925F3 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf144aQ925F3 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Rnf144aQ925F3 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf144aQ925F3 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf144aQ925F3 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf144aQ925F3 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf144aQ925F3 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf144aQ925F3 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf144aQ925F3 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf144aQ925F3 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf144aQ925F3 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf144aQ925F3 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf144aQ925F3 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf144aQ925F3 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf144aQ925F3 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf144aQ925F3 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf144aQ925F3 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf144aQ925F3 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf144aQ925F3 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf144aQ925F3 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf144aQ925F3 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf144aQ925F3 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf144aQ925F3 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf144aQ925F3 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf144aQ925F3 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf144aQ925F3 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf144aQ925F3 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf144aQ925F3 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf144aQ925F3 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf144aQ925F3 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf144aQ925F3 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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