Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms