Protein–RNA interactions for Protein: Q920R6

Atp6v0a4, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 4, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0a4Q920R6 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp6v0a4Q920R6 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp6v0a4Q920R6 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp6v0a4Q920R6 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp6v0a4Q920R6 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp6v0a4Q920R6 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp6v0a4Q920R6 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp6v0a4Q920R6 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp6v0a4Q920R6 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp6v0a4Q920R6 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp6v0a4Q920R6 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp6v0a4Q920R6 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp6v0a4Q920R6 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp6v0a4Q920R6 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp6v0a4Q920R6 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp6v0a4Q920R6 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp6v0a4Q920R6 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp6v0a4Q920R6 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp6v0a4Q920R6 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp6v0a4Q920R6 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp6v0a4Q920R6 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp6v0a4Q920R6 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp6v0a4Q920R6 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp6v0a4Q920R6 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp6v0a4Q920R6 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp6v0a4Q920R6 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp6v0a4Q920R6 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp6v0a4Q920R6 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp6v0a4Q920R6 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp6v0a4Q920R6 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp6v0a4Q920R6 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp6v0a4Q920R6 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp6v0a4Q920R6 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp6v0a4Q920R6 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp6v0a4Q920R6 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp6v0a4Q920R6 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp6v0a4Q920R6 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp6v0a4Q920R6 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp6v0a4Q920R6 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp6v0a4Q920R6 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp6v0a4Q920R6 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp6v0a4Q920R6 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp6v0a4Q920R6 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp6v0a4Q920R6 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp6v0a4Q920R6 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp6v0a4Q920R6 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp6v0a4Q920R6 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp6v0a4Q920R6 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp6v0a4Q920R6 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp6v0a4Q920R6 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp6v0a4Q920R6 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp6v0a4Q920R6 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp6v0a4Q920R6 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp6v0a4Q920R6 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp6v0a4Q920R6 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp6v0a4Q920R6 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp6v0a4Q920R6 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp6v0a4Q920R6 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp6v0a4Q920R6 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp6v0a4Q920R6 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp6v0a4Q920R6 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp6v0a4Q920R6 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp6v0a4Q920R6 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp6v0a4Q920R6 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp6v0a4Q920R6 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp6v0a4Q920R6 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp6v0a4Q920R6 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp6v0a4Q920R6 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp6v0a4Q920R6 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp6v0a4Q920R6 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp6v0a4Q920R6 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp6v0a4Q920R6 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp6v0a4Q920R6 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp6v0a4Q920R6 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp6v0a4Q920R6 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp6v0a4Q920R6 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp6v0a4Q920R6 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp6v0a4Q920R6 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp6v0a4Q920R6 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp6v0a4Q920R6 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp6v0a4Q920R6 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp6v0a4Q920R6 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp6v0a4Q920R6 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp6v0a4Q920R6 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp6v0a4Q920R6 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp6v0a4Q920R6 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp6v0a4Q920R6 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp6v0a4Q920R6 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp6v0a4Q920R6 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp6v0a4Q920R6 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp6v0a4Q920R6 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp6v0a4Q920R6 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp6v0a4Q920R6 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp6v0a4Q920R6 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp6v0a4Q920R6 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp6v0a4Q920R6 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp6v0a4Q920R6 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp6v0a4Q920R6 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp6v0a4Q920R6 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp6v0a4Q920R6 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms