Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Med28Q920D3 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms