Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZU9

Grin3b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin3bQ91ZU9 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grin3bQ91ZU9 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Grin3bQ91ZU9 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grin3bQ91ZU9 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grin3bQ91ZU9 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grin3bQ91ZU9 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grin3bQ91ZU9 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grin3bQ91ZU9 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grin3bQ91ZU9 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grin3bQ91ZU9 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grin3bQ91ZU9 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grin3bQ91ZU9 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grin3bQ91ZU9 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grin3bQ91ZU9 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grin3bQ91ZU9 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grin3bQ91ZU9 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grin3bQ91ZU9 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grin3bQ91ZU9 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grin3bQ91ZU9 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grin3bQ91ZU9 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grin3bQ91ZU9 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Grin3bQ91ZU9 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin3bQ91ZU9 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin3bQ91ZU9 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin3bQ91ZU9 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin3bQ91ZU9 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin3bQ91ZU9 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin3bQ91ZU9 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin3bQ91ZU9 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin3bQ91ZU9 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin3bQ91ZU9 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin3bQ91ZU9 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin3bQ91ZU9 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin3bQ91ZU9 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin3bQ91ZU9 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin3bQ91ZU9 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin3bQ91ZU9 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin3bQ91ZU9 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin3bQ91ZU9 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin3bQ91ZU9 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin3bQ91ZU9 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin3bQ91ZU9 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin3bQ91ZU9 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin3bQ91ZU9 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin3bQ91ZU9 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin3bQ91ZU9 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin3bQ91ZU9 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin3bQ91ZU9 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin3bQ91ZU9 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin3bQ91ZU9 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin3bQ91ZU9 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin3bQ91ZU9 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin3bQ91ZU9 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin3bQ91ZU9 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin3bQ91ZU9 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin3bQ91ZU9 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin3bQ91ZU9 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin3bQ91ZU9 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin3bQ91ZU9 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin3bQ91ZU9 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin3bQ91ZU9 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin3bQ91ZU9 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin3bQ91ZU9 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin3bQ91ZU9 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin3bQ91ZU9 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin3bQ91ZU9 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin3bQ91ZU9 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin3bQ91ZU9 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin3bQ91ZU9 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin3bQ91ZU9 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin3bQ91ZU9 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin3bQ91ZU9 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin3bQ91ZU9 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin3bQ91ZU9 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin3bQ91ZU9 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin3bQ91ZU9 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin3bQ91ZU9 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin3bQ91ZU9 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin3bQ91ZU9 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin3bQ91ZU9 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin3bQ91ZU9 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin3bQ91ZU9 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin3bQ91ZU9 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin3bQ91ZU9 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grin3bQ91ZU9 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grin3bQ91ZU9 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grin3bQ91ZU9 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grin3bQ91ZU9 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grin3bQ91ZU9 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grin3bQ91ZU9 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grin3bQ91ZU9 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grin3bQ91ZU9 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grin3bQ91ZU9 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grin3bQ91ZU9 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grin3bQ91ZU9 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grin3bQ91ZU9 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Grin3bQ91ZU9 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grin3bQ91ZU9 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grin3bQ91ZU9 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Grin3bQ91ZU9 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms