Protein–RNA interactions for Protein: Q91YQ3

Csdc2, Cold shock domain-containing protein C2, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csdc2Q91YQ3 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Csdc2Q91YQ3 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Csdc2Q91YQ3 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Csdc2Q91YQ3 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Csdc2Q91YQ3 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Csdc2Q91YQ3 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Csdc2Q91YQ3 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Csdc2Q91YQ3 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Csdc2Q91YQ3 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Csdc2Q91YQ3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Csdc2Q91YQ3 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Csdc2Q91YQ3 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Csdc2Q91YQ3 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Csdc2Q91YQ3 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Csdc2Q91YQ3 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Csdc2Q91YQ3 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Csdc2Q91YQ3 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Csdc2Q91YQ3 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Csdc2Q91YQ3 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Csdc2Q91YQ3 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Csdc2Q91YQ3 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Csdc2Q91YQ3 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Csdc2Q91YQ3 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Csdc2Q91YQ3 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Csdc2Q91YQ3 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Csdc2Q91YQ3 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Csdc2Q91YQ3 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Csdc2Q91YQ3 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Csdc2Q91YQ3 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Csdc2Q91YQ3 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Csdc2Q91YQ3 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Csdc2Q91YQ3 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Csdc2Q91YQ3 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Csdc2Q91YQ3 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Csdc2Q91YQ3 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Csdc2Q91YQ3 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Csdc2Q91YQ3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Csdc2Q91YQ3 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Csdc2Q91YQ3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Csdc2Q91YQ3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Csdc2Q91YQ3 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Csdc2Q91YQ3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Csdc2Q91YQ3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Csdc2Q91YQ3 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Csdc2Q91YQ3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Csdc2Q91YQ3 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Csdc2Q91YQ3 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Csdc2Q91YQ3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Csdc2Q91YQ3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Csdc2Q91YQ3 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Csdc2Q91YQ3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Csdc2Q91YQ3 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Csdc2Q91YQ3 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Csdc2Q91YQ3 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Csdc2Q91YQ3 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Csdc2Q91YQ3 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Csdc2Q91YQ3 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Csdc2Q91YQ3 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Csdc2Q91YQ3 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Csdc2Q91YQ3 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Csdc2Q91YQ3 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Csdc2Q91YQ3 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Csdc2Q91YQ3 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Csdc2Q91YQ3 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Csdc2Q91YQ3 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Csdc2Q91YQ3 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Csdc2Q91YQ3 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Csdc2Q91YQ3 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Csdc2Q91YQ3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Csdc2Q91YQ3 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Csdc2Q91YQ3 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Csdc2Q91YQ3 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Csdc2Q91YQ3 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Csdc2Q91YQ3 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Csdc2Q91YQ3 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Csdc2Q91YQ3 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Csdc2Q91YQ3 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Csdc2Q91YQ3 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Csdc2Q91YQ3 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Csdc2Q91YQ3 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Csdc2Q91YQ3 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Csdc2Q91YQ3 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Csdc2Q91YQ3 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Csdc2Q91YQ3 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Csdc2Q91YQ3 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Csdc2Q91YQ3 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Csdc2Q91YQ3 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Csdc2Q91YQ3 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Csdc2Q91YQ3 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Csdc2Q91YQ3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Csdc2Q91YQ3 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Csdc2Q91YQ3 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Csdc2Q91YQ3 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Csdc2Q91YQ3 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Csdc2Q91YQ3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Csdc2Q91YQ3 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Csdc2Q91YQ3 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Csdc2Q91YQ3 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Csdc2Q91YQ3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Csdc2Q91YQ3 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms