Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms