Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr1106-201ENSMUST00000099867 939 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11652-201ENSMUST00000117842 1267 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 AC153529.1-201ENSMUST00000217818 370 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 1700057G04Rik-201ENSMUST00000098477 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm2030-201ENSMUST00000119590 1129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr1480-203ENSMUST00000207904 1209 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Acrbp-201ENSMUST00000032481 584 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr1480-201ENSMUST00000072219 948 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms