Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD57

Sft2d2, Vesicle transport protein SFT2B, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d2Q8VD57 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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