Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCG9

Rfxap, Regulatory factor X-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxapQ8VCG9 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RfxapQ8VCG9 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RfxapQ8VCG9 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms