Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ApobrQ8VBT6 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms