Protein–RNA interactions for Protein: Q8R368

Dnaaf4, Dynein assembly factor 4, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf4Q8R368 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnaaf4Q8R368 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms