Protein–RNA interactions for Protein: Q8R332

Nup58, Nucleoporin p58/p45, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup58Q8R332 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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