Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

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Length 190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Rnf183Q8QZS5 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Rnf183Q8QZS5 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Rnf183Q8QZS5 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
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Rnf183Q8QZS5 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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