Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms